Είναι πλήρως εξοπλισμένο από το ΥΠΕΠΘ με τα απαραίτητα όργανα και αντιδραστήρια για τις εργαστηριακές ασκήσεις των Φυσικών Επιστημών. Διαθέτει επιπλέον βιντεοπροβολέα, μεγάλη οθόνη προβολής, ηλεκτρονικό υπολογιστή, προβολέα (projector) και μεγάλο πίνακα μαρκαδόρου.
Στο εργαστήριο Φυσικών Επιστημών πραγματοποιούνται οι εργαστηριακές ασκήσεις στα μαθήματα της Φυσικής, Χημείας και Βιολογίας αλλά παράλληλα χρησιμοποιείται καθημερινά για τη διδασκαλία των μαθημάτων Φυσικών Επιστημών (Φυσική, Χημεία, Βιολογία κλπ) σε συνδυασμό με την Αίθουσα Φυσικών Επιστημών. Τα μαθήματα γίνονται με τη βοήθεια των νέων τεχνολογιών (ηλεκτρονικός υπολογιστής, βιντεοπροβολέας, εκπαιδευτικό λογισμικό) αλλά και με τη χρήση του πίνακα.
